57º Congresso da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical

Dados do Trabalho


Título

(R)evolução: A linguagem R como ferramenta de otimização da vigilância da covid-19 no Distrito Federal-DF

Introdução

As ações de Vigilância em Saúde precisam ser oportunas e flexíveis para possibilitar a devida tomada de decisão. Nesse período pandêmico, também veio à tona a necessidade dos Serviços de Vigilância em Saúde se adequarem à chamada "revolução dos dados". Nesse contexto, o uso de linguagens como o R, software gratuito e flexível, é de grande utilidade. Desde o início da pandemia são realizadas diariamente pelo e Centro de Informações Estratégicas em Vigilância em Saúde do Distrito Federal (CIEVS-DF) atividades que envolvem, a captação, análises, consolidação, visualização e divulgação de dados. Esses processos de trabalho eram realizados por meio do uso do Microsoft Excel, que possui limitações como a dependência da checagem manual e baixa capacidade de processamento de grande volume de dados.

Objetivo(s)

Otimizar os processos de trabalho da vigilância da covid-19 no DF por meio da linguagem R para gerar ações de saúde mais oportunas.

Material e Métodos

O processo de automação foi realizado com a linguagem R, que permite manipulação, visualização, análise e comunicação de dados de forma mais flexível e rápida do que o predominante uso do Excel e Word. Os processos de automatização incluem: 1 - consolidação de planilhas Excel com diferentes estruturas, tratamento dos dados e identificação de casos novos/reinfecções por meio de cruzamento de diferentes bases de dados da covid-19; 2 - análise de qualidade para identificação de inconsistências e duplicidades; 3 - produção diária de boletim epidemiológico contendo textos, gráficos, tabelas e mapas; 4 - envio de bancos consolidados para as Regiões de Saúde (RS); 5 - cálculo e atualização da Matriz de Risco. Foram implementadas cinco atividades completamente automatizadas: captação, tratamento e notificação dos casos de covid-19; emissão diária do Boletim Epidemiológico e Resumo de Óbitos; envio de bancos consolidados para as RS; cálculo e atualização da Matriz de Risco; análises de qualidade do banco de dados.

Resultados e Conclusão

Os técnicos de saúde agora usam um único software, o RStudio, com um único script para cada atividade, utilizando poucos cliques. Somadas, as automações economizam cerca de 90 horas semanais de trabalho, reduzindo a sobrecarga da equipe e permitindo o foco em outras tarefas, além de reduzir a probabilidade de erro nos processos de trabalho. A linguagem R se provou uma opção eficaz para apoiar as decisões governamentais em relação à pandemia de covid-19 por produzir informações relevantes e em tempo hábil.

Palavras-chave

Automatização
RMarkdown
Programação

Área

Eixo 02 | Tecnologia e Inovação em saúde

Categoria

NÃO desejo concorrer ao Prêmio Jovem Pesquisador

Autores

Carolina Musso, Priscilleyne Ouverney Reis, Thayna Maria Holanda Souza, João Pedro Angelici Virginio, Tamara Talita Rodrigues Dias, Ademar Barbosa Dantas-Júnior, Lucas Cunha Azevedo