Dados do Trabalho

Título

(R)evolução: A linguagem R como ferramenta de otimização da vigilância da covid-19 no Distrito Federal-DF

Introdução

As ações de Vigilância em Saúde precisam ser oportunas e flexíveis para possibilitar a devida tomada de decisão. Nesse período pandêmico, também veio à tona a necessidade dos Serviços de Vigilância em Saúde se adequarem à chamada "revolução dos dados". Nesse contexto, o uso de linguagens como o R, software gratuito e flexível, é de grande utilidade. Desde o início da pandemia são realizadas diariamente pelo e Centro de Informações Estratégicas em Vigilância em Saúde do Distrito Federal (CIEVS-DF) atividades que envolvem, a captação, análises, consolidação, visualização e divulgação de dados. Esses processos de trabalho eram realizados por meio do uso do Microsoft Excel, que possui limitações como a dependência da checagem manual e baixa capacidade de processamento de grande volume de dados.

Objetivo(s)

Otimizar os processos de trabalho da vigilância da covid-19 no DF por meio da linguagem R para gerar ações de saúde mais oportunas.

Material e Métodos

O processo de automação foi realizado com a linguagem R, que permite manipulação, visualização, análise e comunicação de dados de forma mais flexível e rápida do que o predominante uso do Excel e Word. Os processos de automatização incluem: 1 - consolidação de planilhas Excel com diferentes estruturas, tratamento dos dados e identificação de casos novos/reinfecções por meio de cruzamento de diferentes bases de dados da covid-19; 2 - análise de qualidade para identificação de inconsistências e duplicidades; 3 - produção diária de boletim epidemiológico contendo textos, gráficos, tabelas e mapas; 4 - envio de bancos consolidados para as Regiões de Saúde (RS); 5 - cálculo e atualização da Matriz de Risco. Foram implementadas cinco atividades completamente automatizadas: captação, tratamento e notificação dos casos de covid-19; emissão diária do Boletim Epidemiológico e Resumo de Óbitos; envio de bancos consolidados para as RS; cálculo e atualização da Matriz de Risco; análises de qualidade do banco de dados.

Resultados e Conclusão

Os técnicos de saúde agora usam um único software, o RStudio, com um único script para cada atividade, utilizando poucos cliques. Somadas, as automações economizam cerca de 90 horas semanais de trabalho, reduzindo a sobrecarga da equipe e permitindo o foco em outras tarefas, além de reduzir a probabilidade de erro nos processos de trabalho. A linguagem R se provou uma opção eficaz para apoiar as decisões governamentais em relação à pandemia de covid-19 por produzir informações relevantes e em tempo hábil.

Palavras-chave

Automatização
RMarkdown
Programação