Dados do Trabalho

Título

VIGILÂNCIA GENÔMICA DE AMOSTRAS POSITIVAS DE ARBOVIROSES COLETADAS NO ESTADO DE MATO GROSSO

Introdução

No Brasil, os arbovírus estão circulando de forma simultânea com SARS-CoV-2, causando um cenário epidemiológico preocupante que tem colocado o país no centro das atenções mundiais quando o assunto é saúde pública.

Objetivo(s)

O estudo realizou a vigilância genômica visando explorar o cenário epidemiológico causado pelos arbovírus no estado de Mato Grosso, caracterizando os vírus da dengue e da chikungunya, atualmente endêmicos nessa região.

Material e Métodos

No período de 31 janeiro a 3 de fevereiro de 2021, foram analisadas 85 alíquotas de RNA com resultado positivo prévio para arboviroses (DENV- 1 e DENV- 2) oriundas do LACEN-MT. Todas as amostras recebidas foram submetidas à síntese de cDNA e sucessiva reação de PCR utilizando um conjunto de primers patógeno-específicos para amplificação do genoma viral completo. Os amplicons obtidos foram utilizados no preparo das bibliotecas genômicas e posteriormente, submetidos ao sequenciamento de genoma viral através da tecnologia de sequenciamento por nanoporos utilizando o sequenciador portátil MinION. Os dados brutos do sequenciamento foram processados através do software Genome Detective (https://www.genomedetective.com/).

Resultados e Conclusão

Foram processadas 84 amostras de casos positivos de DENV (DENV-1=15 e DENV-2=50) que após PCR 65 amostras apresentaram uma quantidade de DNA suficiente (>2ng) para serem sequenciadas. O sequenciamento utilizando a metodologia de nanoporos possibilitou a geração de 15 genomas completos de DENV-1 com cobertura média de 85.37% e 50 genomas completos de DENV-2, com cobertura média de 77,46%. Entre os genomas de DENV-1, 15 genomas foram classificados como Dengue 1 genótipo V os 50 genomas de Dengue 2 como genótipo III. CONCLUSÃO: As novas sequências obtidas de DENV foram montadas utilizando o software Genome Detective e genotipadas com a ferramenta Dengue Vírus Typing Tool, disponível online. A respeito do vírus do Dengue sorotipo 1 as análises preliminares sugeriram que o a reemergencia do vírus dengue no estado de Mato Grosso foi caraterizada pela circulação do DENV-1 genótipo V e as análises filogenética preliminares sugeriram que três independentes eventos e introdução ocorreram ao longo do tempo. Sobre o vírus da Dengue sorotipo 2 as análises preliminares sugeriram que o a reemergencia do vírus dengue no estado de Mato Grosso foi caraterizada pela circulação do DENV-2 genótipo III.

Palavras-chave

Genética; Vírus; Saúde Pública

Área

Eixo 08 | Arboviroses