Dados do Trabalho

Título

MONITORAMENTO DE VARIANTES DE SARS-COV2 CIRCULANTES NO ESTADO DE MATO GROSSO EM 2021

Introdução

Objetivo(s)

OBJETIVO: identificar e monitorar as variantes de SARS-CoV-2 que circulam no Estado de Mato Grosso.

Material e Métodos

METODOLOGIA: Durante o período de 16 de novembro a 6 de dezembro de 2021, realizou o sequenciamento de 32 genomas completos de SARS-CoV-2, de pacientes com diagnóstico positivo para COVID-19, referentes a 22 municípios do Estado de Mato Grosso. A escolha das amostras baseou-se na representatividade das regiões geográficas do Estado, além de atender aos critérios estabelecidos pela Vigilância Epidemiológica como contatos suspeitos e/ou COV (variantes de interesse) e VOI (variantes de interesse), variantes de interesse), óbitos, casos graves e de rápida evolução, amostras com carga viral elevada (entre 15 e 26), além de pacientes com diagnóstico positivo para SARS-CoV-2 com histórico de viagem para fora do estado e /ou Brasil. Os genomas foram sequenciados usando tecnologia desenvolvida pela Thermo Fisher Scientific (Ion Genestudio S5 Plus), com a grande maioria cobrindo mais de 90% do genoma total. As sequências genômicas obtidas foram analisadas usando o software Genome Detective-Coronavirus Typing Tool, disponível online (https://www.genomedetective.com/app/typingtool/virus/). A avaliação da linhagem foi realizada usando a ferramenta de Atribuição Filogenética de LINeages de Surto Global Nomeado disponível em (https://github.com/hCoV-2019/pangolin).

Resultados e Conclusão

RESULTADO: A co-circulação de 03 diferentes cepas de SARS-CoV-2 no Estado de Mato Grosso foi identificada ao longo do tempo e provavelmente está relacionada a inúmeros eventos de importação e tipagem viral, concomitante ao elevado número de infecções registradas no Estado. VOC gama ou P.1 e suas sublinhas correspondem a cerca de 97% dos casos que variam de março a agosto de 2021 valores de CT (limite de ciclo) que variaram entre 15 e 26. CONCLUSÃO: Os dados sugerem que a mobilidade humana aliada à falta de distanciamento social e restrições são fatores que contribuem para a disseminação do SARS-CoV-2 no estado de Mato Grosso. O sequenciamento do genoma é fundamental para entender as rotas de transmissão e sua evolução ao longo do tempo, além de fazer inferências filogenéticas mais detalhadas sobre a disseminação do vírus no estado.

Palavras-chave

Pesquisa; Genética; Pandemia;

Área

Eixo 09 | COVID-19