Dados do Trabalho

Título

ESTUDO IN SILICO DA DIVERSIDADE DO GENE CCR5 EM POPULAÇÕES GLOBAIS E POTENCIAIS MARCADORES MOLECULARES PARA FUTUROS ESTUDOS DE ASSOCIAÇÃO

Introdução

As quimiocinas desempenham um papel crucial no combate às infecções virais, recrutando células imunes para os locais de infecção, e aumentando sua função citotóxica e sua capacidade de produzir mediadores antivirais. Sua atuação nas células alvo é mediada por membros da família de receptores 7-transmembrana ligados à proteína G. O papel do receptor 5 de quimiocina CC (CCR5; OMIM No. 601373) já foi descrito em várias infecções virais: Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV), Vírus da Hepatite C (HCV) e Hepatite B (HBV), Vírus do Nilo Ocidental (WNV), Vírus da Encefalite por Carrapato (TBEV).

Objetivo(s)

Investigar as variantes no gene CCR5 mais prevalentes em grupos populacionais globais; identificar potenciais marcadores moleculares para futuros estudos de associação.

Material e Métodos

A análise foi realizada utilizando conjunto de dados disponibilizados, de forma pública na internet, no banco de dados Ensembl versão 106 © EMBL-EBI e 1000 Genomes Phase 3. Filtros foram aplicados: primeiro para selecionar os polimorfismos com frequências do alelo mutante, maiores que 1% e, segundo para manter apenas mutações já com significado clínico associado.

Resultados e Conclusão

Com a aplicação do primeiro filtro, foram identificadas 19 variantes com frequência, do segundo alelo mais comum, maiores que 1%. A maior frequência foi observada no rs746492 (44,5%). O alelo mutante com menores frequência entre os polimorfismos foi o rs1800452 (1,2%). Com o segundo filtro o resultado retornou oito polimorfismos, destes somente dois eram do tipo INDEL (rs333 e rs796065305) os demais eram do tipo SNP (rs1800944, rs1800942, rs1800940, rs1800560, rs1800452 e rs142829420), sendo dois por mudança da matriz de leitura, quatro de sentido trocado, um códon de parada e um ainda indefinido. O rs333 já está bem descrito na literatura associado à resistência à infecção pelo HIV-1. Um recente estudo de associação do genoma identificou uma relação genética entre insuficiência respiratória grave em pacientes hospitalizados com COVID-19 e a região cromossômica 3p21.31 que abriga vários genes, por exemplo - CXCR6, XCR1, CCR1, CCR3, CCR2, CCR5 - fortalecendo o possível papel do CCR5 na suscetibilidade a doenças virais. Conclusão: O CCR5 é um forte candidato com potencial para influenciar na suscetibilidade à infecção por vírus, como por exemplo, por SARS-CoV-2.

Palavras-chave

CCR5, Vírus, Quimiocinas, Receptores de Quimiocinas