Dados do Trabalho

Título

Monitoramento das linhagens de SARS-CoV-2 circulantes no Estado do Pará

Introdução

Uma das maiores relevâncias na saúde pública mundial registrada recentemente, com uma magnitude que alcançou mais de seis milhões de mortes, devido sua alta taxa de transmissibilidade e distribuição global, trata-se da doença Coronavírus 2019 (COVID-19), causada pelo agente etiológico SARS-CoV-2 (betacoronavírus da síndrome respiratória aguda grave) diagnósticado laboratorialmente pelo teste padrão-ouro de transcrição reversa seguida da reação em cadeia mediada pela polimerase em tempo real (RT-qPCR) a partir de amostras de swabs nasofaríngeos de pacientes em fase aguda da doença. Diversos protocolos foram desenvolvidos para o monitoramento da doença devido principalmente a alta frequência de variantes de preocupação - VOC (variant of concern). Utilizou-se os insumos quadriplex para detecção do vírus na região alvo no gene N e detecção sugestiva das variantes VOCs Alfa, Beta, Delta e Ômicron, através da presença ou ausência das deleções (Del) S106, G107 e F108 no gene ORF1a (nsp6) e Del H69 e V70 no gene Spike.

Objetivo(s)

Avaliou-se a frequência da circulação das VOCs utilizando o ensaio de inferência como triagem inicial seguida da confirmação pelo sequenciamento genético de nova geração de amostras analisadas no período de janeiro 2022 a julho de 2022.

Material e Métodos

Foram analisadas 470 amostras na 1ª fase dos testes que caracterizou a entrada da variante Ômicron no Estado do Pará e 690 amostras analisadas (2ª fase) que caracterizaram a tendência das diversidades e a predominância das sublinhagens da Ômicron. Essas amostras fazem parte da rede de vigilância e são diagnosticadas via fluxo do Ministério da Saúde pelos laboratórios centrais.

Resultados e Conclusão

Os resultados dos ensaios foram comprovados pelas sequências genéticas identificadas e registradas no mês de janeiro de 2022, com a migração da linhagem Delta para a Ômicron com predomínio da sub linhagem BA.1 e a recente identificação e registro das sub linhagens da Ômicron (BA.2;3;4;5), com a diminuição da sub linhagem BA.1 em junho de 2022, estes últimos resultados coincidem com a elevação dos registros oficiais de casos da doença, sugerindo que estas variantes sejam responsáveis pelos novos surtos. O ensaio apresentou rápida, alta sensibilidade e especificidade, de importância crucial para o monitoramento inicial da inferência das linhagens/sub linhagens e da prevalência ao longo do tempo na população, auxiliando a vigilância epidemiológica e genômica nacional em suas estratégias de controle e ação ativa.

Palavras-chave

VOCs, linhagens, SARS-CoV-2