Dados do Trabalho

Título

PREDIÇÃO E ANÁLISE IN SILICO DE EPÍTOPOS DE SARS-COV-2

Introdução

Nas últimas décadas, ocorreram avanços tecnológicos relevantes relacionados à manipulação genética das micobactérias. Dentre estes, podemos citar a geração de vetores bifuncionais para o uso em bactérias como Escherichia coli e micobactérias, indução de genes promotores com diferentes formas de expressão e a elaboração de sistema de indução de antígenos. As subcepas da vacina BCG recombinante (BCGr) funcionam como um sistema de “entrega de produtos gênicos” heterólogos que são capazes de produzir uma resposta imunológica protetiva e muitas vezes duradora

Objetivo (s)

Realizar estudo in sílico de possíveis epítopos do SARS-CoV-2 que possam propor o desenvolvimento de uma BCGr

Material e Métodos

Estudo in sílico baseado em experimentos publicados na literatura, sendo inicialmente realizada análise para obter a sequência da proteína spike através do banco de dados do Protein Data Base (PDB). Posteriormente foram aplicados uma série de filtros imunológicos para escolher os epítopos com maior afinidade para Complexo Principal de Histocompatibilidade do tipo I (MHC-I. Os critérios de seleção utilizados foram antigenicidade, imunogenicidade e toxicidade. Para verificar a predição a uma resposta para linfócitos T CD8+, foi usada a ferramenta NET CTL1.2. Após a seleção dos peptídeos foi mensurada a cobertura populacional desses peptídeos com base nas frequências genotípicas HLA (Antígeno Leucocitário Humano), bem como sua ligação ao MHC-I.

Resultados e Conclusão

Ao analisar a proteína spike verificamos a presença de 37 epítopos com predição para uma resposta via linfócito T citotóxica (LTC). Dos epítopos selecionados, 17 (46%) apresentaram resultado positivo para antigenicidade. Desses 17 peptídeos apenas nove (53%) apresentaram resultado positivo para imunogenicidade. Com relação a cobertura populacional verificamos um resultado de 79,8%, tendo como base a população brasileira. Conclusão. Foi verificado que a proteína spike apresenta epítopos imunológicos potenciais que ajudam tanto no desenvolvimento de uma resposta imunologia via LTC, como em uma possível utilização no desenvolvimento de uma BCGr

Palavras-chave

Epítopos, SARS-CoV-2, BCG recombinante, Lifócitos T citotóxicos

Agradecimentos

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)