Dados do Trabalho

Título

Uso do WGS como ferramenta de epidemiologia genômica para Mycobacterium tuberculosis no município do Rio de Janeiro

Introdução

O Rio de Janeiro é segunda capital no Brasil com mais casos de tuberculose droga resistente e multidroga resistente (TB-DR/MDR) e lidera o coeficiente de óbitos por tuberculose (TB) no País. Os baixos indicadores sociais colaboram para esta taxa de incidência da doença no estado. Portanto, é essencial identificar as linhagens e sublinhagens de cepas pertencentes ao complexo Mycobacterium tuberculosis (MTBC), estudar a dinâmica de transmissão e as mutações genômicas associadas com a resistência micobacteriana aos fármacos anti-tuberculose.

Objetivo (s)

Caracterizar o perfil genômico de cepas circulantes pertencentes ao CMTB, isolados de pacientes com TB ativa no Município do Rio de Janeiro.

Material e Métodos

Análise de 69 cepas de MTBC sensíveis e resistentes, isoladas de pacientes do munícipio do Rio de Janeiro atendidos no período de 2016 a 2020, por meio do Whole Genome Sequencing (WGS) e de métodos fenotípicos (Mycobacteria Growth Indicator Tube - MGIT - e teste de proporção em ágar).

Resultados e Conclusão

As sublinhagens mais de frequentes de Mtb foram: 4.7 mainly T (28,9%), 4.3.4.2 LAM (18,8%) e 4.1.2.1 Haarlem (17,4%). Estabelecendo uma distância de 5 SNPs entre os isolados, encontramos 6 clusters, dos quais 5 apresentavam cepas MDR, pré-XDR ou XDR (45/69). A maior parte dos isolados concentrou-se no bairro da Tijuca e foram transmitidos de forma primária, sugerindo uma cadeia de transmissão. Cinquenta e seis por cento dos isolados eram MDR, 7,3% pré-XDR e 1,5% XDR. As mutações mais frequentes foram KatG_p.Ser315Thr para INH; e rpoB_p.Ser450Leu para RIF- em 3 cepas observou-se a disputed mutation rpoB_p.Leu430Pro (RIF), o que pode acarretar resultados de resistência falsos negativos no antibiograma fenotípico (MGIT).

Este estudo demonstra como o WGS pode ser uma ferramenta para a vigilância epidemiológica e de suporte para o diagnóstico. Também pode aprimorar o conhecimento sobre a dinâmica da TB e preencher a carência de informações sobre a diversidade genômica de MTBC na cidade do Rio.

Palavras-chave

Tuberculose, resistência primária, WGS, disputed mutation

Agradecimentos

CAPES