Dados do Trabalho

Título

INVESTIGAÇÃO EPIDEMIOLÓGICA DO SARS-COV-2 E CODETECÇÃO COM OUTROS VÍRUS RESPIRATÓRIOS NA POPULAÇÃO INFANTIL DO ESTADO DE RONDÔNIA, AMAZÔNIA OCIDENTAL BRASILEIRA.

Introdução

A evolução do SARS-CoV-2 ainda é preocupante, especialmente na população infantil, onde os dados são subestimados e a cobertura vacinal é baixa.

Objetivo (s)

Realizar uma investigação epidemiológica do SARS-CoV-2 e codetecção com outros vírus respiratórios na população infantil do Estado de Rondônia.

Material e Métodos

Foram analisados 364 indivíduos, entre 0,1 mês a 17 anos de idade, selecionados em unidades de saúde de municípios do Estado de Rondônia, no período de junho de 2021 a setembro de 2022. Foram coletados dados de prontuários médicos e eletrônicos para caracterização epidemiológica. A coorte positiva para SARS-CoV-2 foi quantificada por RT-qPCR em tempo real e, posteriormente, foram avaliadas para 16 tipos de vírus respiratórios: Adenovírus; Bocavírus; Rinovírus; HCoV-229E; HCoV-HKU1; HCoV-NL63; HCoV-OC43; Metapneumovírus; Vírus Sincicial Respiratório A e B; Parainfluenza 1,2,3; Influenza A (H1N1, H3N2) e Influenza B. Espécimes positivas para SARS-CoV-2 foram sequenciadas por sequenciamento de nova geração (NGS). As cepas foram classificadas usando o sistema Pango, e o método de máxima verossimilhança (ML) para a análise filogenética.

Resultados e Conclusão

A coorte positiva para SARS-CoV-2 representou 26,4% (96/364). Observou-se uma prevalência para o sexo masculino, com 65,6% (63/96). Indivíduos entre 10 a 14 anos apresentaram a maior taxa de positividade, com 30.2% (29/96). Constatou-se codetecção viral em 5,2% (5/96) da coorte, sendo 2,1% (2/96) com Influenza A (H3N2); 1,0% (1/96) com Rinovírus; 1,0% (1/96) com Adenovírus e 1,0% (1/96) com Metapneumovírus e Rinovírus. Desses casos, 60% (3/5) foram diagnosticados com pneumonia e bronquiolite. As crianças não imunizadas com nenhuma dose da vacina da COVID-19 apresentaram a maior taxa de casos, com 68,7% (66/96). Foram sequenciadas 82,3% da coorte positiva (79/96) por NGS. Observou-se que a variante Delta foi a mais frequente com 39,2% (31/79), seguida pela Omicron com 32,91% (26/79), que apresentou o maior número de subvariantes. A carga viral apresentou uma mediana de 7,26 log10 cópias/mL, com uma média de 4 dias de sintomas. Indivíduos não vacinados apresentaram maiores taxas de infecção por SARS-CoV-2. As variantes Delta e Omicron foram associadas a maior parte dos casos, com um aumento de subvariantes observados no período do estudo. Parte significativa dos pacientes que apresentaram codetecção viral apresentaram sintomas mais graves. No entanto, o tema requer mais estudos.

Palavras-chave

SARS-CoV-2, COVID-19, Codetecção viral, População infantil

Agradecimentos

FAPERO, EPIAMO