Dados do Trabalho

Título

Novas mutações no sistema regulatório associado à resistência à polimixina em Klebsiella pneumoniae

Introdução

A resistência aos antimicrobianos é uma das maiores adversidades para a saúde pública em escala mundial. Neste contexto, as infecções por bactérias gram-negativas multirresistentes aumentaram expressivamente, o que levou à reintrodução das polimixinas na prática clínica como última opção terapêutica para essas infecções. No entanto, observou-se que Klebsiella pneumoniae resistente aos carbapenêmicos tem apresentado altas taxas de resistência à polimixina, o que dificulta as opções terapêuticas disponíveis.

Objetivo (s)

Investigar a resistência à polimixina B e seus mecanismos moleculares em um isolado de K. pneumoniae, com base na análise do sequenciamento de genoma completo

Material e Métodos

A cepa foi isolada de uma infecção sanguínea em um hospital de Salvador, Bahia. A suscetibilidade aos antimicrobianos foi testada com o sistema Vitek, enquanto a suscetibilidade à polimixina foi determinada por microdiluição em caldo. O sequenciamento completo do genoma foi realizado com a plataforma Illumina NextSeq 500 e a montagem do genoma foi feita com o Unicycler (v0.4.8). A anotação genômica foi feita com o Rapid Annotation using Subsystem Technology (RAST) e o ResFinder (v4.0). Para investigar mutações nos genes relacionados à resistência à polimixina em K. pneumoniae, foram realizados alinhamentos com o genoma de K. pneumoniae MGH 78578, usando o Geneious Prime (2020.1.2) e o BLASTn (NCBI). O impacto funcional das mutações foi predito com a plataforma PROVEAN

Resultados e Conclusão

O isolado foi resistente aos β-lactâmicos, aminoglicosídeos, fluoroquinolonas, sulfametoxazol-trimetropim e polimixinas. A montagem do genoma gerou 72 contigs. A anotação revelou genes associados à caracterização fenotípica, incluindo blaNDM-1, blaCTX-M-15, blaSHV-182, OmpK37 e OmpA para β-lactâmicos; aph(6)-Id, aph(3')-Via e aph(3'')-Ib para aminoglicosídeos; gyrA e parC mutados, dfrA14 e sul2 para fluoroquinolonas, trimetropim e sulfonamida, respectivamente. Também foram encontrados genes de bombas de efluxo, como OqxA, OqxB, emrR, rsmA, marA, acrR, RND, adeF, KpnG, KpnH, KpnE, KpnF, eptB, baeR, LptD. Não foram encontrados genes plasmidiais de resistência à polimixina, mas foram identificados genes cromossômicos potencialmente envolvidos na resistência. Foram encontradas mutações nos genes pmrB, phoQ e crrB: 2/4 no gene pmrB (T246 e R256), 1/4 no gene phoQ (R16L) e 1/4 no gene crrB (C68S). Não há relatos na literatura sobre a mutação R16L no gene phoQ.

Palavras-chave

Resistência aos antimicrobianos, Bactérias-MDR, Polimixina

Agradecimentos

FAPESB; CNPQ e CAPES