Dados do Trabalho

Título

O TRANSPORTADOR ABCG2 DE Leishmania COMO ALVO PARA LIGANTES NATURAIS VIA ANCORAGEM MOLECULAR DE LARGA ESCALA

Introdução

As leishmanioses tegumentar e visceral são problemas de saúde pública mundial. Seu controle efetivo depende, entre outros fatores, de novas alternativas terapêuticas menos tóxicas e mais eficazes.

Objetivo (s)

Realizar a ancoragem molecular (docking) de produtos naturais contra o transportador ABCG2 e elencar as moléculas com maior potencial leishmanicida.

Material e Métodos

Para obter a estrutura da proteína ABCG2 de Leishmania sp., fez-se a modelagem molecular comparativa (programa Modeller v9.24.) para seleção de modelos estruturais no banco de dados PDB. Validou-se o modelo por meio do programa Procheck. Com o webserver Prosite, identificou-se o sítio de ligação do alvo e respectivos resíduos de aminoácidos do sítio receptor. Para as simulações de ancoragem molecular, utilizaram-se 187.119 moléculas de origem natural a partir banco de moléculas ZINC Database. O alvo molecular (ABCG2) e os ligantes (moléculas naturais) foram preparados (flexibilização de ligantes, protonação, adição de hidrogênios e cargas de Kollman) no programa Raccoon v2. O centro da caixa para a ancoragem foi determinado via Autodock Tools, com dimensão de 30 nm³. O docking foi executado pelo programa Autodock Vina, que determinou as melhores conformações dos complexos proteína-ligante com cálculos envolvendo a Energia Livre de Gibbs (ΔG), grandeza termodinâmica relacionada à espontaneidade do processo. Assim, o top 0.1% (187 ligantes com as melhores energias) foi selecionado para classificação química (NPClassifier v1.5) e demais filtros, com a análise de farmacodinâmica (SwissADME) tolerando até uma violação à regra de Lipinski.

Resultados e Conclusão

O modelo 7OJ8 foi o mais adequado (entre 643 do PDB) e os resíduos aminoacídicos 15-17, 26-28 e 51-55 definidos como o sítio ativo da proteína ABCG2 de Leishmania, com centro da caixa situado em X= 126.520, Y=135.225 e Z=145.996. Após a ancoragem, as 187 moléculas com as melhores energia de ligação (-13,8 Kcal.mol-1 a -17,0 Kcal.mol-1) foram selecionadas para análise de sua dinâmica farmacêutica. Atenderam aos principais critérios 20 moléculas: alcaloides (17), flavonoides (2) e classe indefinida (1). Destas, 17 com alta absorção gastrointestinal e 07 com permeação da barreira hematoencefálica. A triagem in silico de moléculas naturais inibidoras da proteína ABCG2 de Leishmania revelou 20 ligantes promissores para testes in vitro, pelo perfil de baixa toxicidade e natureza farmacológica viável.

Palavras-chave

Leishmaniose; Proteína ABC; Ancoragem Molecular; Produtos Naturais.

Agradecimentos

IEC/SVSA/MS e FINEP