Dados do Trabalho

Título

DESCRIÇÃO CLÍNICA E GENOTÍPICA DA COVID19 DURANTE A PRIMEIRA E A SEGUNDA ONDA EPIDEMIOLÓGICA NO CENTRO SUL DE MATO GROSSO, BRASIL

Introdução

A COVID19 é uma síndrome respiratória aguda severa que emergiu globalmente, sendo o Brasil o país mais afetado da América Latina.

Objetivo (s)

Caracterizar os dados clínicos e epidemiológicos de pacientes de unidades de saúde do Mato Grosso, Brasil, durante a primeira e segunda onda epidemiológica da COVID19.

Material e Métodos

Foram coletados, entre maio de 2020 e agosto de 2021, dados clínicos, epidemiológicos e amostras biológicas de 251 pacientes. Estes foram testados por RT-qPCR para SARS-CoV-2. Amostras com CT< 25 foram amplificadas e sequenciadas. Dados genômicos foram analisados por ferramentas de bioinformática. Dados clínicos e epidemiológicos foram analisados pelo teste qui-quadrado e por regressão logística stepwise.

Resultados e Conclusão

Os casos analisados foram classificados clinicamente como assintomáticos (8%), leves (22.7%), moderados (26.3%) e graves (43%), com idade média de 53,6 e 54,8 anos na primeira e segunda onda, respectivamente. Foram classificados como sobrepeso ou obesos (68,5%) e apresentavam comorbidades cardiovasculares (41,83%) e metabólicas (29,5%). Na segunda onda apresentaram >11 dias de doença moderada a grave (p.0,0001), >25% de opacidade em vidro fosco nos pulmões (p.0002) e desfecho fatal (p.0,004) quando comparado à primeira onda. O desfecho fatal foi associado à idade média de 61 anos (p.0,001), presença de comorbidades (p. 0,001-0,03) e >25% de extensão de opacidades em vidro fosco nos pulmões (p.0,0001). A regressão logística mostrou que a mortalidade aumentou significativamente de acordo com o aumento da idade (1,05 vezes), com > 25% de opacidades em vidro fosco nos pulmões (3,18 vezes) ou comorbidades imunológicas (0,62), cardíacas (0,75) ou metabólicas (3,42). No total, 23 genomas de SARS-CoV-2 foram recuperados, a linhagem B.1.1.33 foi identificada em 8 pacientes da primeira onda e 15 na segunda onda pertencentes à linhagem P.1. As sequências B.1.1.33 compartilham seis das sete mutações definidoras de linhagem. Quanto à variante P.1, os genomas compartilharam todas as mutações definidoras, exceto ORF1 b:E 1264D. Aumento da idade, comorbidades imunológicas, metabólicas e cardiovasculares, apresentar >11 dias de sintomas e >25% de extensão do vidro fosco foram relacionados ao desfecho fatal, sendo a segunda epidemiológica onda mais grave nesta população de estudo.

Palavras-chave

Epidemiologia, Filogenia, Coronavírus

Agradecimentos

Ao CGLAB - Ministério Da Saúde pela doação do kit Allplex SARS-CoV-2 RT-qPCR utilizados neste estudo. CAPES. RDS CNPq PQ2. GISAID.