Rodrigo Stabeli foi diretor de pesquisa e inovação do Instituto de Pesquisas em Patologias Tropicais de Rondônia - Ipepatro (2006-2009), diretor da Fundação Oswaldo Cruz - unidade de Rondônia (2009-2013), Vice-Presidente, titular da pasta Pesquisa e Laboratórios de Referência, VPPLR (2013-2017). Foi membro titular do alto conselho da CTNBio na área de saúde humana (2018 - 2023).  Atualmente exerce o cargo de especialista/pesquisador titular em saúde pública e dirige o escritório da Fiocruz em São Paulo, primeiro escritório técnico da Fiocruz no Estado de São Paulo; é professor Associado do Depto de Medicina da Universidade Federal de São Carlos (RTP/20). Stabeli é membro da Academia Brasileira de Ciências (2008), membro ordinário da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência e Sociedade Civil e Sociedade Brasileira de Medicina Tropical (Sbmt). Stabeli coordenou as ações de enfrentamento da Emergência Sanitária de Importância Internacional decretada em 2016, pela Fiocruz. Atualmente integra o Centro de Operação de Emergência e Catástrofes em Saúde da OPAS/OMS  sendo especialista em Vigilância Laboratorial